Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TOP3BO95985 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms