Protein–RNA interactions for Protein: D6RBM5

USP17L23, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 23, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L23D6RBM5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
USP17L23D6RBM5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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