Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GOLGA6L4A6NEF3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms