Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms