Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HPS5Q9UPZ3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms