Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CIPCQ9C0C6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CIPCQ9C0C6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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