Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms