Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms