Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TIMM29Q9BSF4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms