Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HLA-CQ95604 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HLA-CQ95604 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms