Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HAPLN4Q86UW8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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