Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNGA3Q16281 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms