Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRD3Q15059 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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