Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NRG1Q02297 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms