Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERFP50548 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERFP50548 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERFP50548 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms