Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2BP42772 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2BP42772 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms