Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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