Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRAPPC2P0DI81 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC2P0DI81 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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