Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA3O75145 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms