Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms