Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms