Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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RNF185Q96GF1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RNF185Q96GF1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RNF185Q96GF1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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RNF185Q96GF1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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RNF185Q96GF1 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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