Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SNX20Q7Z614 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX20Q7Z614 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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