Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TCF23Q7RTU1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms