Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms