Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms