Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBB3Q13509 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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