Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LSAMPQ13449 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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