Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTBSQ01459 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTBSQ01459 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms