Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1S1P61966 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1S1P61966 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1S1P61966 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AP1S1P61966 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AP1S1P61966 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms