Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRE11P49959 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRE11P49959 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms