Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF30P17039 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF30P17039 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF30P17039 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms