Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSF2P04141 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms