Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBDO15205 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBDO15205 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms