Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP290O15078 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEP290O15078 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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