Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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