Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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