Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR9

APOLD1, Apolipoprotein L domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOLD1Q96LR9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOLD1Q96LR9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms