Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
RNF185Q96GF1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
RNF185Q96GF1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms