Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HRCT1Q6UXD1 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms