Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC38Q502W7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms