Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KNOP1Q1ED39 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KNOP1Q1ED39 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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