Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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RTL8BQ17RB0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RTL8BQ17RB0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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