Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TRAM2Q15035 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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