Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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