Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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TRAF2Q12933 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF2Q12933 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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