Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
ZNF85Q03923 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms