Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ABCE1P61221 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms