Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HLA-DMAP28067 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HLA-DMAP28067 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms