Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FGF1P05230 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FGF1P05230 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms